镇江市穆源民族学校位于西津渡古建筑群中，座落于镇江伯先公园东侧，由原穆源小学和宝盖路中心小学合并而得名。穆源小学创立于1906年（清光绪32年），初名为穆源学堂，是全国第一所回民学堂。百年办学史中，涌现出原人民日报副社长、著名出版家范用，著名航天科学家嵇钧生，北师大教授向锦江等众多英才。

学校以“弘扬民族精神，传承民族文化，凸显民族教育，培育民族新人”为办学特色。先后围绕市级课题《在学校教育中开展民族文化教育的研究》和省级课题《穆源学堂：民族文化教育的模式创新》，以民族文化文化为教育核心，构建以“穆源学堂十佳学童”评选活动为主的德育课程体系；构建以“30+10，精讲巧练”为主的民族文化课堂教学渗透模式；开展以“一班一民族，一班一民俗”为主的民族文化体验活动等努力实现“传统文化与现代文化”的和谐统一。

学校先后获得江苏省民族团结教育宣传基地、镇江市民族团结进步模范集体、镇江市特色学校等殊荣。